Menurut catatan sejarah lampau.
Pulau Kaniungan digunakan warga bersembunyi dari para perombak Sulu Selatan.
Lambat laun, pulau yang semula kosong itu, perlahan digunakan menjadi tempat tinggal oleh warga yang bersembunyi dari perompak itu.
Mereka generasi pertama masyarakat Pulau Kaniungan Besar.
Menjalani hidup di Pulau Kaniungan Besar, warga memanfaatkan Pulau Kaniungan Kecil, menjadi lokasi pemakaman bagi orang tua dan kerabat mereka yang telah meninggal dunia.
Pulau Kaniungan Kecil punya sarat hubungan spiritual bagi warga.
Di sana lah tempat leluhur mereka dimakamkan.
